当前科研院所改制进入深水区，涉及多个层面，存在诸多问题。从一线的咨询实践中，我们认为主要存在于以下三个方面的问题：
1、愿不愿
从下而上地看，科研院所改制在诸多层面并不能形成统一认识，改革推进的意愿参差不齐。究其原因，一是对我国新一轮改革背景缺乏深刻的认识，尤其是对本轮国资国企改革的原因、目标、主要方面等；二是对自身所在的科研院所的发展环境缺乏全面的、深刻的、长远的认识，原有的体制机制往往造成了盲人摸象似的短见。因此，我们认为：具体到某个科研院所的改制，首要任务是，从顶层设计层面形成既全面系统而又个性深刻的统一认识，如内部发展问题、外部发展环境、改制后的战略定位、指导思想与发展原则、发展目标与实现路径等，以此调动上上下下的积极性，解决改制意愿这一前置问题。
2、会不会
鉴于科研院所与企业在体制机制方面存在的巨大差异，如价值理念、业务特性、市场拓展、员工薪酬、研发导向、生产方面、权责审批、经费来源、审计税收、养老金医疗、上级管理等，科研院所改制需要较强的方案设计能力与落地执行能力，如股权结构、公司治理、组织架构、薪酬制度、员工持股等，甚至资本运作、上市规划、战略投资者引进等。方案的优劣直接决定执行的质量与效率，尤其是在改制过程中可能存在的各种显性与隐性的需求，因此综合性的管理咨询机构是优先选择对象。
3、能不能
即使解决了前述“愿不愿”与“会不会”的问题，科研院所改制还存在“能不能”的问题，即外部条件是不是支持科研院所改制，能不能解决科研院所实施改制存在的一些后顾之忧的问题，如领导的责权利对等、容错机制的建立以及员工持股对象的身份转变等。这些问题是难点和重点，是科研院所改制的深水区，需要提前获取上级单位的支持和授权，因此向上营销至关重要。
以上是我们观察到的当前科研院所改制存在的三大问题。这三大问题环环相扣，需要全面系统、有计划、有步骤地解决。
